Is-элемент

Cтраница 2

Мигрирующие элементы, представленные транспозонами и IS-элементами, - это линейные молекулы двухнитевой ДНК, размеры которых колеблются от 200 до 6000 пар нуклеотидов. [16]

Роль сайт-специфической рекомбинации в транспозиции [ У транспозонов, перемещающихся с помощью реплика тивион транспозиции, образование коиитегрзта является промежуточной стадией реакции ( 77. Коиитег - - раты разрезаются с помощью роГО уЧЗСТКа ЛОКаЛИЗЗЦИИ. ПОЭТОМУ ПрвД. [17]

Роль сайт-специфической рекомбинации в транспозиции. [19]

Перемещение по крайней мере некоторых транспозонов и IS-элементов происходит путем их вырезания с места старой локализации с последующим встраиванием в какое-нибудь другое место того же или нового репликона. Такой механизм называется консервативным в отличие от полу-консервативной репликативной транспозиции. В этом случае на месте старой локализации транспозона остается двуцепочечный разрыв ДНК-В тоже время известно, что перемещение бактериальных транспозонов, как правило, не сопровождается их исчезновением из старого участка локализации. Поэтому предполагают, что вырезание транспозона вызывает самоубийство донора - деградацию той конкретной молекулы ДНК, в которой в результате вырезания транспозона остался разрыв, однако существуют и другие возможности. [20]

Роль сайт-специфической рекомбинации в транспозиции. [21]

Перемещение по крайней мере некоторых транспозонов и IS-элементов происходит путем их вырезания с места старой локализации с последующим встраиванием в какое-нибудь другое место того же или нового репликона. Такой механизм называется консервативным в отличие от полуконсервативной репликативной транспозиции. В этом случае на месте старой локализации транспозона остается двуцепочечный разрыв ДНК - В тоже время известно, что перемещение бактериальных транспозонов, как правило, не сопровождается их исчезновением из старого участка локализации. Поэтому предполагают, что вырезание транспозона вызывает самоубийство донора - деградацию той конкретной молекулы ДНК, в которой в результате вырезания транспозона остался разрыв, однако существуют и другие возможности. По-видимому, по описанному или сходному механизму перемещается транспозон Тп5 и ряд IS-элементов. [22]

Именно это полуметилированное состояние существенно активирует и концы IS-элемента, и синтез транспозазы. В результате частота вырезания транспозона из полуметилированной ДНК на несколько порядков выше, чем из ДНК, полностью метилированной. Другими словами, транспозок чувствует, прореплицировался он или нет. Способность вырезаться сразу после репликации снимает все недостатки механизма консервативного вырезания-встраивания. Во-первых, обеспечивается сохранение мобильного элемента на прежнем месте, так как элемент вырезается лишь из одной из двух молекул ДНК, образовавшихся после репликации. Наличие второй копии допускает, в принципе, рекомбинационную репарацию оставшегося после вырезания транспозона двуцепочечного разрыва, хотя не ясно, действительно ли она происходит или имеет место самоубийство донора. Во-вторых, чувствительность к метилированию обеспечивает дополнительную регуляцию транспозиции: при передаче транспозона в новую бактериальную клетку в составе трансмиссивной или мобилизуемой плазмиды он сразу оказывается в полуметилированном состоянии ( при конъюгации передается одна цепь ДНК, которая достраивается до дуплекса в реципиентной клетке), что повышает вероятность его перемещения в другие репликоны клетки-реципиента. [23]

Именно это полуметилированное состояние существенно активирует и концы IS-элемента, и синтез транспозазы. В результате частота вырезания транспозона из полуметилированной ДНК на несколько порядков выше, чем и ДНК, полностью метилированной. Другими словами, транспозон; чувствует, прореплицировался он или нет. Способность вырезаться сразу после репликации снимает все недостатки механизма консервативного вырезания-встраивания. Во-первых, обеспечивается сохранение мобильного элемента на прежнем месте, так как элемент вырезается лишь из одной из двух молекул ДНК, образовавшихся после репликации. Наличие второй копии допускает, в принципе, рекомбинационную репарацию оставшегося после вырезания транспозона двуцепочечного разрыва, хотя не ясно, действительно ли она происходит или имеет место самоубийство донора. Во-вторых, чувствительность к метилированию обеспечивает дополнительную регуляцию транспозиции: при передаче транспозона в новую бактериальную клетку в составе трансмиссивной или мобилизуемой плазмиды он сразу оказывается в полуметилированном состоянии ( при конъюгации передается одна цепь ДНК, которая достраивается до дуплекса в реципиентной клетке), что повышает вероятность его перемещения в другие репликоны клетки-реципиента. [24]

Именно это полуметилированное состояние существенно активирует и концы IS-элемента, и: синтез транспозазы. В результате частота вырезания транспозона из полуметилированной ДНК на несколько порядков выше, чем из ДНК, полностью метилированной. Другими словами, транспозон: чувствует, прореплицировался он или нет. Способность вырезаться сразу после репликации снимает все недостатки механизма консервативного вырезания-встраивания. Во-первых, обеспечивается сохранение мобильного элемента на прежнем месте, так как элемент вырезается лишь из одной из двух молекул ДНК, образовавшихся после репликации. Наличие второй копии допускает, в принципе, рекомбинационную репарацию оставшегося после вырезания транспозона двуцепочечного разрыва, хотя не ясно, действительно ли она происходит или имеет место самоубийство донора. Во-вторых, чувствительность к метилированию обеспечивает дополнительную регуляцию транспозиции: при передаче транспозона в новую бактериальную клетку в составе трансмиссивной или мобилизуемой плазмиды он сразу оказывается в полуметилированном состоянии ( при конъюгации передается одна цепь ДНК, которая достраивается до дуплекса в реципиентной клетке), что повышает вероятность его перемещения в другие репликоны клетки-реципиента. [25]

На основании полного восстановления активности му-тантных генов при вырезании IS-элементов и транспозонов предполагают, что вырезание происходит абсолютно точно и что дуплици-рованный участок ДНК-мишени снова оказывается представленным одной копией. В принципе, такой результат может быть достигнут за счет гомологичной рекомбинации между окружающими транспо-зон дуплицированными последовательностями или за счет ошибки репликации, вызванной наличием на концах транспозонов инвертированных повторов. [26]

Некоторые бактериальные транспозоны. [27]

Транспозонами ( Тп-элементами) называют сегменты ДНК, обладающие теми же свойствами, что и IS-элементы, но содержащие, кроме того, гены, не имеющие непосредственного отношения к транспозиции. Транспозоны могут нести гены устойчивости к антибиотикам, гены токсинов или гены дополнительных ферментов клеточного метаболизма. В общем, для транспозонов характерны те же гены, которые встречают в плазмидах. Транспозон может быть устроен так же, как IS-элемент, но с дополнительным геном. Однако важно отметить, что часто два IS-элемента, оказавшиеся поблизости друг от друга, способны перемещаться вместе, одновременно перенося заключенный между ними сегмент ДНК. Таким образом, два распо - оженных рядом IS-элемента могут образовать транспозон. [28]

Некоторые бактериальные транспозоны. [29]

Транспозонами ( Tn-элементами) называют сегменты ДНК, обладающие теми же свойствами, что и IS-элементы, но содержащие, кроме того, гены, не имеющие непосредственного отношения к транспозиции. Транспозоны могут нести гены устойчивости к антибиотикам, гены токсинов или гены дополнительных ферментов клеточного метаболизма. В общем, для транспозонов характерны те же гены, которые встречают в плазмидах. Транспозон может быть устроен так же, как IS-элемент, но с дополнительным геном. Однако важно отметить, что часто два IS-элемента, оказавшиеся поблизости друг от друга, способны перемещаться вместе, одновременно перенося заключенный между ними сегмент ДНК. Таким образом, два распо - оженных рядом IS-элемента могут образовать транспозон. [30]

Страницы: 1 2 3 4