Анализ - нуклеотидная последовательность
Cтраница 1
Анализ нуклеотидной последовательности показывает, что начальная часть РНК способна образовывать большое число двунитчатых структур. По-видимому, в данном случае сильно развитая вторичная структура транскрипта мешает связыванию с ним р-фактора, без которого терминации в местах пауз не происходит. [1]
Система SEQ помогает специалистам по молекулярной биологии в проведении нескольких видов анализа нуклеотидных последовательностей. ЭС может запомнить, отыскать и проанализировать последовательности нуклеотидов нуклеиновых кислот, а также провести статистический анализ структурной гомологии и симметрии. [2]
Сегодня известны первичные структуры более 2000 белков, причем все возрастающая информация поступает из анализа нуклеотидной последовательности генов. Для тех, кто старается более глубоко понять язык аминокисютных последовательностей, доступен уже огромный материал - обширный текст, который в целом представляет собой существенные фрагменты книги жизни. Что может дать более глубокий его анализ. Бесспорно, он совершенно необходим в изучении связи между строением н функцией отдельных представителей пептидно-белковой природы. Но, может быть, он приведет нас к открытию более общего белкового кода, позволит нам в будущем в той нли иной мере предсказывать свойства белков по их первичной структуре. Это уже можно делать достаточно успешно в отношении пространственной структуры. Вряд ли природа придумала аминокислотный алфавит из 20 букв случайно. Есть над чем подумать, и все возрастающий поток новых данных по аминокислотным последовательностям отнюдь не делает каждый новый шаг в этом направлении более скучным - напротив, он воодушевляет нас, рождает новые пути и концепции и вновь и вновь обращает нас к вопросу о тайне химической азбуки живого. [3]
Однако р-фактор вызывает терминацию не во всех местах пауз. Анализ нуклеотидной последовательности показывает, что начальная часть РНК способна образовывать большое число двунитчатых структур. По-видимому, в данном случае сильно развитая вторичная структура транскрипта мешает связыванию с ним р-фактора, без которого терминации в местах пауз не происходит. [4]
Последняя выполняет важную клеточную функцию, она входит в состав рибонуклеопротеидных частиц, узнающих сигнальный пептид на N-конце новообразованного сек-ретируемого белка. Частицы участвуют в биосинтезе секретиру-емых белков, обеспечивая прикрепление рибосомы к мембранам эндоплазматической сети. Анализ нуклеотидной последовательности коротких повторов показывает, что матрицей для их образования послужили 7S РНК, тРНК и, наконец, UPHK, подвергшиеся процессингу и ошибочному полиаденилированию. Возможно, образование шпильки на З - конце молекул обеспечило затравку ( праймер) для обратной транскриптазы. [5]
Короткие повторы, по-видимому, возникли в результате рет-ропозиции ДНК-копий, образованных на частично процессирован-ных тРНК и 7SPHK - Последняя выполняет важную клеточную функцию, она входит в состав рибонуклеопротеидных частиц, узнающих сигнальный пептид на N-конце новообразованного сек-ретируемого белка. Частицы участвуют в биосинтезе секретиру-емых белков, обеспечивая прикрепление рибосомы к мембранам эндоплазматической сети. Анализ нуклеотидной последовательности коротких повторов показывает, что матрицей для их образования послужили 7S РНК, тРНК и, наконец, UPHK, подвергшиеся процессингу и ошибочному полиаденилированию. Возможно, образование шпильки на З - конце молекул обеспечило затравку ( праймер) для обратной транскриптазы. [6]
 |
Трехмерная модель Na K f АТФазы. [7] |
Чуть позднее были расшифрованы аминокислотные последовательности р-субъединиц фермента из двух первых источников. Во всех этих исследованиях использованы главным образом методы анализа нуклеотидных последовательностей, соответствующих их структурным генам. [8]
Следует отметить три основных этапа в их развитии. Сенгера ( 1953) по установлению аминокислотной последовательности инсулина, второй - с широкого введения в структурный анализ белка автоматического секвенатора ( начало 70 - х годов) и, наконец, третий - с разработки скоростных методов анализа нуклеотидной последовательности ДНК ( А. [9]
Конкретный механизм вытеснения РНК из транскрипционного комплекса под действием р-фактора еще не выяснен. Это вытеснение сопряжено с гидролизом НТФ, при котором, по-видимому, происходит конформационное изменение р-фактора. В результате этого изменения РНК вытесняется из комплекса либо непосредственно р-фактором, либо за счет воздействия на РНК-полимеразу. Анализ нуклеотидной последовательности показывает, что начальная часть РНК способна образовывать большое число двунитчатых структур. По-видимому, в данном случае сильно развитая вторичная структура транскрнпта мешает связыванию с ним р-фактора, без которого терминации в местах пауз не происходит. [10]
Страницы: 1